Die Stiftung Kunstfonds ist eine autonome Fördereinrichtung, die das Modell der "Selbstverantwortung des Kunstbetriebs" in die Praxis umsetzt. Alle grundsätzlichen Fragen der Stiftung werden deshalb vom Stiftungsrat entschieden. Auch Beschlüsse über Zustiftungen und die Betreuung von Künstlernachlässen trifft der Stiftungsrat.

 

Weitere Gremien sind der Vorstand – Monika Brandmeier, Bogomir Ecker und Gerhard Pfennig – und das Kuratorium, das als Jury im Stipendien- und Projektzuschussprogramm für einzelne Künstlerinnen und Künstlern fungiert. Eine eigene Kommission entscheidet als Jury zu den Ausstellungs- und Publikationsförderungen für Künstlergruppen, Kunstvermittler und Verlage. Für Aufnahmeempfehlungen zum Archiv für Künstlernachlässe gibt es eine weitere Kommission, darüber hinaus einen Beirat, der alle Angelegenheiten des Künstlernachlassarchivs begleitet. 

 

Gewählt werden der Vorstand, das Kuratorium, die Kommissionen und der Beirat vom Stiftungsrat, die Geschäftsführerin wurde vom Vorstand bestellt. Eine wichtige Grundlage für allen Gremien der Stiftung Kunstfonds ist, dass bildende Künstlerinnen und Künstler immer die Mehrheit bilden.